ARN non-codant

Question 1

Qu’est-ce qu’un ARN non-codant

Answer 1

ARN fonctionnel qui est rancir mais pas traduit en protéine

Question 2

Quelles sont les 2 classifications de l’ADN dans le génome

Answer 2

Séquence utiles correspondant au gènes
- 10/20% du génome - 1,5/2% exons

Séquences intergéniques (inutile/junk)
- 80/90% du génome
- large portion sont des séquences répétées

Question 3

Quelle est le % du génome transcrit, le nombre de gène qui codent pour une protéine et le nombre de long ncRNA et de miRNA

Answer 3

70% du génome est transcrit en ARN
30 000 gènes codent pour protéines
150 000 lncRNA
400 à 600 miRNA

Question 4

Quels sont les types de ncRNA qui régulent l’expression des gènes

Answer 4

miRNA
siRNA
lncRNA

Question 5

Quelles sont les ARN d’interférence (RNAi)

Answer 5

miRNA
siRNA

Question 6

Qu’est-ce qui distingue les miRNA des lncRNA

Answer 6

miRNA: moins de 200 nucléotides
lncRNA: plus de 200 nucléotides

Question 7

Comment les miRNA, les siRNA et lncRNA agissent sur l’ADN

Answer 7

• régulent l’expression des gènes au niveau transcriptionnel, post-transcriptionnel et au niveau de l’épissage du pré-ARNm
• participent à la formation de l’hétérochromatine, de la modification des histones, du ciblage de la méthylation et du silençage des gènes
• jouent un role dans diverses pathologies comme le cancer
• impliqués dans des phénomène épigénétiques

Question 8

Qu’est-ce que l’épigéntiques

Answer 8

Changement dans l’expression des gènes sans changer la séquences d’ADN; transmissible de facon hériditaires
- role dans l’établissement maintien du type cellulaire (du type de tissu)

Question 9

Quelle est le role des ARN d’interférence (iRNA = miRNA et siRNA) et comment fonctionnent ils

Answer 9

Joue un role dans la défense des cellules contre les séquences nucléotidiques parties (virus ou transposons)

iRNA est un processus biologiques dans lequel les molécules d’ARN inhibent l’expression ou la traduction des gènes en neutralisant l’ARNm ciblées

siRNA synthétiques introduit dans les cellules peuvent inhiber de manière sélective et robuste l’expression des gènes d’intérêt spécifique

Question 10

Décris les miRNA (longueur, chez quel organisme, fonction, ciblage, conservation)

Answer 10

• séquence de ARNnc environ 22 nucléotides
• se trouvent chez la plupart des mammifères, certains virus, plantes
• réguler l’expression des gènes au niveau post-transcriptionnelle
• cible 60% des gènes humains
• sont conservés entre les espèces illustrant leur fonction importante

Question 11

Quel est le role de la plupart de miRNA et comment se fait se role

Answer 11

La plupart des miRNA inhibe l’expression génique des ARNm

Les miRNA fonctionnent via l’appriement de bases avec les séquences complémentaire au sein de la molécule de ARNm cibles

Question 12

Quelles sont les 3 fonctions des miRNA

Answer 12

Permettent de silenciées les molécules d’ARNm ciblées (auxquelles elles sont appariées) de 3 facons

1. Clivage de la molécule d’ARNm en deux
2. Déstabilisiation de l’ARNm par clivage de la queue poly-A: incite les nucléaires à dégrader l’ARNm
3. Réduction de l’efficacité de la traduction des ARNm en protéines: ralenti/bloque la synthèse protéique par le ribosome

Question 13

Lors que la biogenèse des miRNA quels brins sont formés et comment

Answer 13

miRNA: brin guide
miRNA*: brin passager

Étape du DINCING: Dans le cytoplasme, pré-miRNA est modifié par dicter qui couple l’épingle à cheveux de la tige boucle (endonucléase) pour donner 2 complexes de miRNA de 22 nucleotides de long

Question 14

Décris brièvement le mécanisme d’action rendant les 2 brins de miRNA fonctionnels

Answer 14

1. Les miRNA s’associent à une protéine Argonaute (Ago) qui choisi un seul brin (brin guide)
2. D’autres protéines + Ago et le miRNA forment le complexe RISC (RNA-induced silencing complex/complexe miRNA ribonucléoprotéine)
3. Dans ce complexe, miRNA et sa cible de ARNm interagissent

Question 15

Pourquoi la protéine Ago est-elle indispensable au complexe RISC

Answer 15

Permet de lier le mRNA mature pour que ce dernier puisse guider RISC vers le bon ARNm cible

Question 16

Quels sont les 5 mécanisme d’actions du complexe RISC pouvant agir sur ARNm

Answer 16

1. Appariement étendu (presque parfait) du miRNA sur ARNm pour cliver l’ARNm en deux (SLICING) par la protéines Ago
2. Appariement pas extensif (imparfait/partiel/réduit - 8 nucléotides) du miRNA sur l’ARNm et séquestration dans des P-Bodies
   - Ago ne coupe pas l’ARN mais inhibe la traduction qui va être déstabilisée
   - les ARNm vont être séquestrés dans des structures cytosoliques appelées P-Bodies (Processing bodies) où a lieu la dégradation des ARNm
   - P-Bodies: structure dynamique qui contient l’enzyme Dcp1 (décaping enzyme) et des enzyme de dégradation des ARNm
3. miRNA partiellement complémentaire peuvent inhiber l’initiation de la traduction de l’ARNm cible en se liant au début du ARNm
4. miRNA partiellement complémentaire peuvent accélérer la déadénylation (dégradation de la queue Poly-A) et entrainer la dégradation précoce du ARNm
5. miRNA peuvent parfois provoquer la modification des histones et la méthylation de l’ADN des sites promoteurs qui affectent l’expression des gènes cibles

Question 17

Qu’est-ce qu’un P-Body

Answer 17

Structure cytosolique qu permet de dégrader les ARNm dont la traduction est inhibée via des enzymes comme la Dcp1 et des enzymes de dégradation des ARNm

Question 18

Qu’y a t il de spéciale abec la protéine Ago2

Answer 18

Permet de cliver directement l’ARNm cible chez l’humain

Question 19

Résume les étapes de la biogenèse

Answer 19

1. Transcription du miRNA par l’ARN polymérase II + maturation ( donne le pri-miRNA)
2. Cropping: complexe Drosha (enzyme)/Pasha (DGCR8 - reconnaissance) =mircoprocessueur; clive le pri-miRNA pour donner des pré-miRNA avec 2 extrémité 3’ non apparié
3. Export: exportine-5 permet export des pré-miRNA à l’extérieur du noyau par reconnaissance des extrémités 3’ (dépendant de RAN-GTP)
4. Dicing: protéine Dicer clive la tige boucle des pré-miRNA pour former deux miRNA (guide et passager)
5. Association du brin guide de miRNA par Ago et formation du complexe RISC

Question 20

Qu’est-ce que le complexe RISC

Answer 20

RNA-induced silencing complexe
Complexe miRNA ribonucléoprotéine
- contient des enzymes dont Ago qui s’associent au miRNA et qui permettent d’agir sur la molécule de ARNm

Question 21

Combien de nucléotides contiennent les lncRNA

Answer 21

plus de 200 nucléotides

Question 22

Quelles sont les 4 caractéristiques des lncRNA

Answer 22

1. exprimés plus faiblement que les gènes codants pour des protéine
2. Expression remarquablement spécifique à certains types de tissu
3. Enrichis dans le noyau
4. Montre une faible conservation se séquences même si certains le sont

Question 23

Comment sont définis les gènes des lncRNA

Answer 23

Définis par leur position relative au gènes situés à proximité; régulent l’expression des gènes codants; n’agissent pas sur la synthèse protéique