Classification bactérienne - microbio Flashcards

(51 cards)

1
Q

Quelles sont les 3 principales raisons pour lesquelles on identifie les bactéries?

A
  • Augmenter les chances de succès du traitement
  • Diminuer les effets secondaires et risques de résistance induite par un traitement inapproprié ou trop large
  • Obtenir des informations sur l’épidémiologie (locale et santé publique)
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Q

Qu’est-ce que l’identification préliminaire?

A
  • Identification du Gram
  • Identification de la morphologie
  • Identification du genre bactérien
    -Staphylococcus, escherichia, etc.
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3
Q

Qu’est-ce que l’identification finale?

A
  • Identification de l’espèce bactérienne
    -Staphylococcus aureus, escherichia coli, etc.
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4
Q

Quels sont les tests d’identification primaire?

A
  • Conditions de croissance
  • Coloration de Gram
  • Morphologie et agencement
  • Tests biochimiques rapides
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Q

Qu’est-ce que la culture bactérienne?

A
  • Milieu (gélose, bouillon)
  • Atmosphère (aérobie, anaérobie, microaérophile)
  • Température
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6
Q

Qu’est-ce que la croissance bactérienne?

A
  • Absence ou présence de croissance selon les caractéristiques de culture
  • Quantification et vitesse de croissance
  • Culture pure, culture mixte
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7
Q

Qu’est-ce qu’un bouillon?

A
  • Milieu liquide
  • Nutritif
    -Accélérer la croissance des bactéries du spécimen
  • Diluant
    -Obtenir une quantité standardisée de bactéries pour ensemencer une gélose (pour un test, antibiogramme, etc.)
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8
Q

Qu’est-ce qu’une gélose?

A
  • Milieu solide (agar)
  • Nutritif
  • Permet la croissance de colonies individuelles (UFC)
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9
Q

Qu’est-ce que l’UFC?

A
  • Unité formant colonie
  • Le micro-organisme ou l’agrégat de micro-organisme qui va donner naissance, sur un milieu gélifié, à une colonie lorsqu’une quantité donnée du liquide infectant est étalée sur ce milieu gélifié
  • Une bactérie (UFC) se divisera jusqu’à donner une colonie visible
  • Base de l’unité de mesure pour quantification de la culture
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10
Q

Comment faire la quantification des cultures de liquides inoculés?

A
  • Compter le nombre de colonies sur la gélose
  • On assume qu’une colonie visible provient d’une UFC
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11
Q

Comment faire la quantification des cultures d’inoculum non standardisé?

A
  • Observer jusqu’à quel quadrant les colonies poussent (l’inoculum s’épuise de quadrant en quadrant)
    -1+ (1er quadrant)
    -2+ (1er et 2e quadrant)
    -3+ (1e, 2e et 3e quadrant)
    -4+ (tous les quadrants)
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12
Q

Vrai ou faux? On ne peut pas faire de quantification de quadrant avec une culture pure

A

Vrai

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13
Q

Quelles sont les trois géloses principales?

A
  • Gélose sang
  • Gélose chocolat
  • Gélose MacConkey
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14
Q

Quelles sont les caractéristiques de la gélose sang?

A
  • Sang de mouton
  • Non sélective
  • Non différentielle
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15
Q

Quelles sont les caractéristiques de la gélose chocolat?

A
  • Sang chauffé pour faire éclater les GR
  • Non sélective
  • Non différentielle
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16
Q

Quelles sont les caractéristiques de la gélose MacConkey?

A
  • Cristal violet, sels biliaires, lactose, neutral red
  • Sélective et différentielle
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17
Q

Que permet la gélose sang dans l’identification bactérienne?

A
  • Permet de voir si la batérie est capable d’hémolyse
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18
Q

Quelles sont les trois possibilités d’hémolyse sur gélose sang?

A
  • α-hémolyse (hémolyse incomplète)
  • β-hémolyse (hémolyse incomplète)
  • γ-hémolyse (pas d’hémolyse)
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19
Q

Quel est l’avantage de la gélose chocolat?

A
  • Les GR sont éclatées et relâchent leurs facteurs de croissance dans le milieu
    -Facilite la croissance de bactéries fastidieuses (qui ont de la difficulté à pousser en temps normal)
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20
Q

Qu’est-ce qu’une gélose sélective?

A
  • Inhibe la croissance de certaines bactéries
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21
Q

Qu’est-ce qu’une gélose différentielle?

A
  • Réaction qui entraîne un changement visible sur la culture
22
Q

Qu’est-ce qui procure la sélectivité à la gélose de MacConkey? Et la propriété différentielle?

A

Sélective:

  • Sels biliaires inhibent les Gram +
  • Sélectionne les Gram -

Différentielle:

  • Si le lactose est utilisé dans la croissance, il y a un changement du pH du milieu (colonie rose)
23
Q

Pourquoi faire une coloration de Gram?

A
  • Décrire l’arrangement spatial (gram +)
  • Sélectionner les bactéries potentiellement pathogènes vs colonisantes
  • Guider les tests biochimiques subséquents
  • Guider le choix d’antibiotiques empiriques
24
Q

Vrai ou faux? Les Gram - ont une couche épaisse de peptidoglycan

A

Faux. Les Gram + ont une couche épaisse de peptidoglycan

25
Quelle couleur apparaissent les Gram - au microscope?
Rose
26
Quelles sont les différentes formes des bactéries ?
* Cocci -Diplocoques * Bacille * Spirochète (plus rares)
27
Comment classifie-t-on les bactéries?
* **Gram** -Positif -Négatif * **Forme** -Cocci -Bacille * **Métabolisme** -Aérobie -Anaérobie
28
Quelles sont les caractéristiques du staphylococcus aureus? | cocci/bacille, gram +/-, amas/chaîne/spores/diplocoque
* Cocci * Gram + * En amas
29
Quelles sont les caractéristiques du streptococcus pyogenes? | cocci/bacille, gram +/-, amas/chaîne/spores/diplocoque
* Cocci * Gram + * En chaîne
30
Quelles sont les caractéristiques du bacillus anthracis? | cocci/bacille, gram +/-, amas/chaîne/spores/diplocoque
* Bacilles * Gram + * Avec spores
31
Quelles sont les caractéristiques du neisseria meningitidis? | cocci/bacille, gram +/-, amas/chaîne/spores/diplocoque
* Cocci * Gram - * Diplocoques
32
En quoi consistent les tests biochimiques?
* Se basent sur les **éléments distinctifs** dans la **physiologie bactérienne** (métabolisme) * **Différencient les bactéries** de manière **phénotypique** * Peuvent aider à **orienter le clinicien** en **attendant l'identification finale** ou en l'absence de technologies comme le MALDI-TOF ou l'amplification d'acides nucléiques (PCR)
33
Quels sont les tests biochimiques de base pour les cocci Gram+?
* Catalase * Coagulase sur lame * Coagulase en tube
34
Que détecte le test de catalase?
* Présence de l'enzyme catalase * Capacité de transformer le peroxyde d'hydrogène en H2O + O2 (faire des bulles)
35
Quels sont les tests biochimiques de base pour les bacilles Gram -?
* OF (oxydation-fermentation) glucose * Test de l'oxydase * Indole
36
Qu'est-ce que le test oxydation-fermentation glucose?
* Sépare les bactéries en fonction de leur catabolisme du glucose * Réaction en présence (aérobie) et en absence (anaérobie) d'oxygène * Résultats: -Négatif (vert) -Positif (jaune) * Sépare les bactéries en: -Fermentaire (jaune) -Non-fermentaire (vert) -Non-saccharolytiques (non-fermentaire et non oxydatif)
37
Qu'est-ce que le test oxydase?
* Sépare les bactéries en fonction de leur capacité d'oxydation (réduction par respiration aérobie) pour produire de l'énergie * Présence du cytochrome oxydase avec l'O2 comme accepteur final d'électron
38
Qu'est-ce que les fermentaires?
* Fermentent le glucose * Oxydase - * En général, germes qui **colonisent** le **tractus gastro-intestinal** (entérobactéries) -Infections GI, urinaires, nosocomiales **Exemples:** -E.coli -Klebsiella pneumoniae -Salmonella -Yersinia
39
Qu'est-ce que les non-fermentaires?
* Ne fermentent pas le glucose * Oxydase + ou - * **Germes opportunistes ou nosocomiaux** -Abx à répétition, hospitalisation ou soins de longue durée, FK, soins intensifs -Résistance intrinsèque à de nombreux Abx -Infections pulmonaires, GI, plaies **Exemples:** -Pseudonomas aeruginosa -Acinobacter baumanii -Stenotrophomonas maltophila
40
Qu'est-ce que le test de l'indole?
* Sépare les bactéries en fonction de leur **capacité d'oxydation du tryptophan** pour produire de l'indole * Présence d'enzymes tryptophanase * Résultats: -Positif (rose) -Négatif
41
Qu'est-ce que le MALDI-TOF?
* Test phénotypique avancé * Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight * On met une colonie bactérienne sur une plaque de matrice chimique et on ionise les protéines bactériennes avec un laser -Il y a une accélération des particules protéiques dans un champs magnétique -Mesure de l'empreinte protéique
42
Quel est le premier test à faire pour les cocci gram + aérobies?
Le test de la catalase
43
Que signifie un résultat positif à la catalase chez les cocci gram +?
* Il s'agit d'un staphylococcus ou d'un micrococcus
44
Que signifie un résultat négatif à la catalase chez les cocci gram +?
* Il s'agit d'un entérococcus ou d'un streptococcus
45
Vrai ou faux? Le S.aureus a une coagulase négative
Faux. Le S.aureus a une coagulase **positive**
46
Quels streptocoques sont a-hémolytiques?
* S.viridans * S.mitis * S.pneumoniae
47
Quels sont les streptocoques b-hémolytiques (Lancefield)?
* S.pyogenes (SGA) * S.aglalactiae (SGB) * S.dysgalactiae (SGC et SGG)
48
Quels sont les streptococcus gamma-hémolytiques?
* Enterococcus (anciennement) * S.bovis complexe (SGD)
49
Vrai ou faux? Si le test OF glucose est négatif, la bactérie est non-fermentaire
Vrai
50
Nommez une bactérie OF glucose + et indole -
E.coli
51
Vrai ou faux? La pseudonomas aeruginosa est une bactérie non-fermentaire avec oxydase négative
Faux. La pseudonomas aeruginosa est une bactérie non-fermentaire avec oxydase **positive**