1
Q
Qu’est-ce que sont les micromycètes?
A
Levures et moisissures
(microscopique)
2
Q
Qu’est-ce que sont les macromycètes ?
A
Champignons macroscopiques
Sporophores/candiophores visibles
3
Q
Donner 8 caractéristiques générales des champignons/mycètes/fungi.
A
- Organismes eucaryotes
- Sans chlorophylle
- Porteurs de spore
- Nutrition par absorption
- Utilisent le carbone organique (hétérotrophes)
- Reproduction asexuée (rarement sexuée)
- Paroi cellulaire contenant typiquement de la chitine et des glucanes
- Saprophytiques (moins de 0,5% sont pathogènes)
4
Q
Définir ce que sont les mycoses
A
Ce sont des infections fongiques touchant les anumaux incluant l’homme
Elles peuvent être superficielles ou frofondes, et même systémiques
5
Q
Qu’est-ce que la mycologie médicale?
A
C’est une discipline distincte de la microbiologie médicale qui consiste à isoler et à caractériser des champignons pathogènes dans le but de caractériser l’origine mycologique ou non d’une pathologie
6
Q
Qui est Hippocrates?
A
Il est le père de la médecine (460-377 b.c.e.)
Il avait identifié des sujets atteints du muguet (Candida albicans)
7
Q
Décrire la mycologie médicale au Moyen-Âge en Europe
A
Des enfants infectés par Trichophyton schoenleinii (dermatophyte-Tinea), un champignon attaquant le cuir chevelu, la peau lisse et les ongles
8
Q
Décrire la mycologie médicale au 20ème siècle
A
- Éclosion de Sporothrix schenckii (infections sous-cutanée) chez 3000 travailleurs miniers en Afrique du Sud (1941-1944).
- 2ème guère mondiale: apparition de zones endémiques aux USA (Histoplasma capsulatum, agent de l’Histoplasmose).
- Ère de la suppression immunitaire et des mycoses opportunistes nosocomiales (Candidoses et aspergilloses):
⇒
Chimiothérapie (traitement du cancer)
Maintenance des greffons (immunosuppression)
VIH/SIDA (1981-)
Maladies auto-immunitaires (Arthrite, Psoriasis, sclérose en plaques, M. inflammatoires chroniques de l’intestin: Maladie de Crohn et rectocolite hémorragique)
9
Q
Décrire la mycologie médicale au 21ème siècle
A
L’âge d’or de la mycologie médicale
- Développement des tests de diagnostiques: tests de mise en culture spécifiques, tests de susceptibilités aux agents antimicrobiens, identification moléculaires (séquençage de gènes ou de séquences d’ADN: ADN ribosomal et ITS)
- Développement d’antifongiques: Azoles et échinocandines
- Avancés dans la compréhension du pouvoir pathogène fongique:
10
Q
Définir le Fungal Genome Initiative
A
Séquençage de plusieurs génomes de champignons pathogènes de l’Homme.
11
Q
Définir la génomique fonctionnelle fongique
A
Analyse de transcriptomes, de proteomes, secrétomes
12
Q
Selon quelles trois catégories se fait la classification des pathogénèses fongiques?
A
- Critères morphologiques
- Taxomanie et phylogénie
- Manifestations cliniques (site d’infection)
13
Q
Sur quoi se base la classification morphologique des mycoses?
A
Sur la forme de la croissance végétative
14
Q
Quels sont les trois types morphologiques de mycoses?
A
- Levures (forme levuriforme)
- Moisissures (champignons filamenteux)
- Champignons dimorphiques (différencient à la fois des filaments et des levures)
15
Q
Donner 3 caractéristiques des levures
A
- Forme la plus simple des champignons
- Se multiplient par bourgeonnement (Saccharomyces cerevisiae et C. albicans -A) ou par fission (Schizosaccharomyces pombe- B)
- -* Les levures pathogènes humains sont désignées par Blastoconidies (C. albicans)
16
Q
Donner 2 caractéristiques des moisissures
A
- Cellules filamenteuses et cylindruques souvent branchées nommées hyphes
- Hyphes avec ou sans septum (Aspergillus ou Mucor)
17
Q
Définir ce qu’est un mycélium
A
C’est une masse d’hyphes
18
Q
Définir ce que sont les pseudohyphes
A
C’est une morphologie associée aux levures et distincte de la forme levure et la forme hyphale.
Ce sont des cellules levuriformes allongées et attachées (en forme de collier)
19
Q
Donner 3 caractéristiques des champignons dimorphiques
A
- Caractéristiques de plusieurs champignons pathogènes endémiques (ex : Blastomyces et Histoplasma)
- Filamentaux à ~ 25°C (dans l’environnement/sol)
- Levures à 37°C (température corporelle)
- Cette morphogénèse est une caractéristique d”identifiaction au laboratoire
20
Q
De quoi dépend la classification taxonomique des mycoses? (3)
A
- Présence/absence de reproduction sexuée (méiose)
- caractères morphologiques (présence de sptum, cycle de vie et physiologie)
- Phylogénie moléculaire/génétique (basée sur la ressemblance des séquences d’ADN)
21
Q
Pourquoi la classification taxonomique est-elle imoprtante pour un clinicien microbiologiste? (2)
A
- Susceptibilité aux agents antifongiques
- Pouvoir pathogène et transmissibilité
22
Q
Schématiser la classification taxonomique des fungi
A
23
Q
Donner 4 caractéristiques des ascomycètes
A
- Représentent 75% des champignons connus
- Levures ou filamenteux
- Reproduction sexuée (ascospores) ou asexuée par bourgeonnement (blastospores/levures) ou par production de spores (conidies)
- Identifiés aux laboratoires cliniques par leurs propagules ou par tests génétiques dans le cas d’espèces qui ont une croissance lente ou inexistante.
24
Q
Donner 7 exemples d’ascomycètes
A
- Candida albicans*
- Aspergillus fumigatus*
- Fusarium*
- Penicillium*
- Alternaria*
- Blastomyces*
- Histoplasma*
25
Donner 2 caractéristiques des basidiomycètes
- Reproduction sexuée par formation des basidiospores (basidium) ou des conidies
- Apparences : levures, filaments, capsules
26
Donner 5 exemples de basidiomycètes
* - Cryptococcus neoformans*
* - C. gattii*
* - Schisophyllum commune*
* - Trichosporon*
* - Malassezia pachydermatis*
27
Donner 3 caractéristiques des glomeromycota mucorales
- Forme primitive des champignons
- Cellules coenocytiques
- Formation de zygospores
28
Donner 4 exemples de glomeromycota mucorales
* - Mucor spp*
* - Rhizopus*
* - Lichtheimia*
* - Apophysomyce*
29
Quelles sont les 5 classes selon la classification basée sur les sites d'infection primaire
- Mycoses superficielles
- Mycoses cutanées
- Infections opportunistes systématiques
- Mycoses sous-cutanées
- Mycoses endémiques
30
Donner 3 exemples/causes des mycoses superficielles
- Tinea versicolor : Infection de la couche supérieure morte kératinisée de l’épiderme
- Infections causées par *Malassezia*
- Problèmes majoritairement cosmétiques.
31
Donner 3 exemples / causes des mycoses cutanées
- Dermatophytes
- Infections touchant la peau, les cheveux et les ongles
- *Trichophyton tonsurans \> T. rubrum \> T. interdigitale \> Microsporum canis*
32
Donner 3 exemples/causes des mycoses opportunistes systématiques
- Infections de tous les organes par des champignons environnementaux (*Aspergillus fumigatus*), ou des endosymbiontes commensaux/Mycobiota (*Candida albicans*)
- Infections touchant des patients dont le système immunitaire est compromis (Porteurs de VIH, patients immunosupprimés, nouveaux nés, femmes enceintes, etc.
- Infections touchant des personnes seines: Cas de champignons dimorphiques
33
Donenr 2 causes des mycoses sous-cutanées
- Mycoses d’implantations (suite à des piqûres ou des traumatismes transcutanés)
- Causées par des champignons mélanisés
34
Donner 2 exemples des mycoses sous-cutanées
* - Sporothrix schenckii*
* - Madurella mycetomatis*
35
Décrire les mycoses endémiques (2)
- Champignons ayant une répartition géographique restreinte.
- Causant majoritairement des infections pulmonaires qui peuvent évoluer en infections systémiques.
36
Donner 8 exemples de mycoses endémiques
- Histoplasmose: *Histoplasma capsultum* (USA centrale-River valleys)
- Blastomycoses: *Blastomyces dermatitidis* (même répartition que *H. capsulatum* mais aussi **Canada-Québec**)
- Coccidiomycose: *Coccidioides immitis, C. posadasii* (Californie et Arizona)
- Paracocciodomycoses: *Paracoccidioides brasiliensis* (Brésil et Colombie)
- Peniciliose: *Penicillium marneffei* (Asie sud-est)
- Sporotrichose: *Sporothrix schenckii* (plusieurs régions du monde)
- *Cryptococcus gatii* (Côtes ouest USA et **Canada**)
37
Quels sont les facteurs de risques des mycoses invasives?
38
Quelles sont les caractérsitiques de la cellule fongique levure? (7)
- Noyau avec membrane nucléaire
- Cytoplasme
- Mitochondrie
- Vacuole
- Réseau de transport vésiculaire : Réticulum endoplasmique et Golgi
- Membrane plasmique
- Paroi cellulaire
39
Quelles sont les caractéristiques de la cellule fongique hyphe? (10)
1- Septum avec le pore septal
2- Corps de Voronine (Woronin body)
3- Noyau avec nucléole
4- Réticulum endoplasmique
5- Mitochondrie
6- Membrane plasmique
7-Paroi cellulaire avec 3 couches: Interne (chitine), intermédiaire (glucane) et externe (mannane)
8- Vacuole
9- Golgi
10- Spitzenkorper
40
Décrire la membrane plasmique de la cellule fongique (3)
- Présence d**’Érgosterol** ("le Cholestérol fongique")
- **Stérol spécifique** des champignons et de certains protozoaires et absent chez les cellules animales
- Constituant de la membrane et contribue à la régulation de sa **fluidité**
41
Quelles sont les 3 couches de la paroi cellulaire de la cellule fongique?
Couche externe
⇒
Mannanes et protéines pariétales
Couche intermédiaire
⇒
Glucane
Couche interne
⇒
Chitine
42
Décrire la constitution de la chitine dans la membrane interne de la paroi cellulaire des cellules fongiques (2)
- 2% et 6% de la masse de la paroi des levures et champignons filamenteux
- Microfibres insolubles du poly ß-(1→ 4)-N -acetylglucosamine polymère associés aux glucanes.
43
Décrire la constitution de la glucane dans la couche intermédiaire de la paroi cellulaire des cellules fongiques (2)
- 58–60% de la masse de la paroi
- ß-(1→ 3)-D –Glucane et ß-(1→ 6)-D –Glucane
44
Décrire la constitution de la mannane dans la couche intermédiaire de la paroi cellulaire des cellules fongiques (3)
- Hémi-cellulose
- Composants majeurs des protéines pariétales (38–40% de la masse de la paroi)
- Antigène majeure de *C. albicans*
45
Décrire la constitution des protéines pariétales dans la couche externe de la paroi cellulaire des cellules fongiques (2)
- Protéines GPI ( glycosyl–phosphatidylinositol-Protéines) associées à la chitine et au ß-1→ 6-glucane
- Fonctions: Adhésines (attachement à l’hôte), Biogenèse de la paroi.
46
Schématiser la paroi cellulaire fongique
47
Donner 6 manifestations cliniques de l'*Aspergillus sp*
- Aspergillomes pulmonaires et cérébrales
- Aspergilloses pulmonaires chroniques
- Infections superficielles : Sinus, otomycose (oreille), onychomycosis (ongles)
- Allergies
- Aspergillus fumigatus
- Aspergillose invasive
48
Donner 3 manifestations cliniques de *Cryptococcus*
* - Cryptococcus gattii*
- Lésions cérébrales et pulmonaires, et Méningites
- Sujets seins et immunosupprimés
49
Donner 3 manifestations cliniques des blastomyces
- *Blastomyces dermatitidis*
- Infection fatale
- Infections pulmonaires, lésions dermiques et
ostéomyélites
50
Donner 2 manifestations cliniques des *Paraoccidioides sp*
- *Paracoccidioides brasiliensis*
- Infections pulmonaires
- Enflement des ganglions lymphatiques
51
Donner 10 exemples de *Candida sp*
- C. albicans
- C. glabrata
- C. dubliniensis
- C. parapsilosis
- C. tropicalis
- C. krusei
- C. lusitaniae
- C. guilliermondii
- C. rugosa
- C. auris
52
Qu'est-ce qu'une candidose?
Une candidose est une infection fongique causée par des levures du genre Candida. Le terme peut désigner tout une gamme de manifestations pathologiques ayant pour facteurs ces champignons levuriformes.
53
Donner 3 caractéristiques de la candidose de *C. albicans*
- La 4ème maladie nosocomiale la plus commune
- Cause fréquente de morbidité et de mortalité chez les patients immunosupprimés
- Hospitalisation très couteuse (≈ 40,000 $)
54
Quel est le mode de vie et de virulence du *C. albicans?*
La virulence de C. albicans est associée à son dimorphisme:
- Hyphes dédiés à l’invasion et la colonisation des organes.
- Levures associées à la dissémination de C. albicans.
55
Quelle est la forme commensale de *C. albicans*?
Retrouvée dans les intestins
56
Quelles sont les morphologies possibles du *C. albicans*?
57
Sur quoi repose le diagnostic des mycoses? (4)
Caractéristiques morphologiques
⇒
Apparence en milieu de culture
Examen microscopique
⇒
Patho-histologie
Diagnostique moléculaire
⇒
ADN, PCR, séquençage, T2Candida
Diagnostique sérologique
⇒
Anticorps
58
Quels sont les 3 types de thérapies antifongiques ?
- Chimique
- Immuno-modulation
- Immunothérapie
59
Nommer 3 classes de molécules antifongiques chimiques
- Azoles
- Chinochandines
- Polyènes
60
Donner un exemple de thérapie antifongique d'immuno-modulation
Vaccination
\* essais cliniques en cours pour un vaccin contre les vaginoses fongiques causées par C. albicans et C. glabrata \*
61
Décrire la thérapie fongique par immunothérapie
C'est une stimulation des défenses immunitaires contre les pathogènes fongiques
62
Donner 3 caractéristiques des azoles
- Antifongiques les plus utilisés
- Fongistatiques
- Utilisés contre des infections systémiques et superficielles
63
Donner 2 sous-classes des azoles
- 1,2,3-Triazoles (Fluconazoles, itraconazole)
- Imidazole (ketoconazole, Clotrimazole)
64
Quelle est la cible cellulaire des azoles?
La membrane plasmique
65
Quelle est la cible moléculaire des azoles?
Ils inhibent la biosynthèse de l'ergosterol
66
Donner 3 caractéristiques des échinocandines
- Antifongiques administrés par intraveineuse.
- Fongicides.
- Utilisés contres des infections systémiques graves.
67
Donner 3 différentes molécules d'échinocandines, et mentionner contre quel fongi elles agissent
Caspofungin (Cancidas-Merck):
⇒
*Contre C. albicans, Aspergillus*
Micafungin (Mycamine, Astellas Pharma)
⇒
*Contre C. albicans*
Anidulafungin (Eraxis, Pfizer):
⇒
*Contre C. albicans*
68
Quelle est la cible cellulaire des échonocandines?
La paroi cellulaire
69
Quelle est la cible moléculaire des échinocandines?
Ils inhibent la biosynthèse des glucanes (inhibition de l'enzyme glucane synthase, Fks 1)
70
Donner 3 caractéristiques des polyènes ou amphotéricine B
- Antifongiques administrés par intraveineuse ou par voie orale.
- Fongistatiques/Fongicides (concentration-dépendante)
- Toxiques, mais la formulation liposomale (AmBisome) réduit sa toxicité.
71
Donner le spectre antifongique des polyènes (4)
* - Aspergillus fumigatus*
* - C. albicsans, C. glabrata, C. krusei, C. lusitaniae*
* - Cryptococcus neoformans*
* - Fusarium oxysporum*
72
Quelle est la cible cellulaire des polyènes?
La membrane plasmique
73
Quelle est la cible moléculaire des polyènes?
Les polyènes inhibent la biosynthèse de l’ergosterol et forment des pores qui fragilisent la membrane
74
Quelles sont les 4 limites des thérapies antifongiques
**Toxicité** pour toutes les molécules connues
⇒
Pourquoi? Ressemblance des cibles thérapeutiques due à la nature eucaryotique des cellules humaines et fongiques
Les échinochandines sont **insolubles.**
Nature **fongistatique** de certaines molécules (azoles)
⇒
Problème de récurrence etrésistance.
- Perte d’efficacité dans certaines niches acides (vagin et abcès)
**- Résistance**
75
Nommer les 2 résistances naturelles aux antifongiques?
- Certains champignons ne sont **pas sensibles** aux antifongiques.
⇒
Exemples: *Candida krusei et C. auris* (à tout), *C. glabrata* (azoles)
- **Biofilm**
76
Décrire la résistance naturelle aux antifongiques par biofilm
Mode de vie sessile (attaché) liée à la contamination des dispositifs médicaux (Cathéters, Prothèses, Pacemakers)
Levures, hyphes et pseudohyphes emballés dans une matrice polysaccharidique qui donne au biofilm une structure en 3D.
Résistance à toutes les molécules : ~ 1000x comparée aux cellules planctoniques
77
Nommer les 3 résistances cliniques aux antifongiques
**Altération de la cible**
⇒
modifications génétiques
**Altération de transport**
⇒
Hyper-activation des transporteurs d’efflux ABC- et MFS
ABC (ATP Binding Cassette) exigent de l’ATP pour l’efflux des drogues.
MFS (Major Facilitator Superfamily) efflux passive des drogues.
**Aneuploïdies**
⇒
Trisomie de certains chromosomes. Duplication de fragments intra-chromosomiques contenant des transporteurs d’efflux de drogues (Cas de C. albicans)
78
Décrire les champignons et maladies inflammatoires intestinales
La maladie de Crohn et la colite ulcéreuse sont accompagnées d’une surcroissance anormale des levures *C. albicans, C. glabrata et C. tropicalis*
79
Quelles sont les 4 causes probables de désastre planétaire?
- Volcans
- Éruption solaire
- Tsunami
- **Épidémie de mycose**
80
Vrai ou faux ?
Les champignons sont les seules microbes connus d'avoir causé une extinction d'une espèce
Vrai
Plusieurs espèces d'amphibiens ont subi ce sort
MED-1206 - Examen II
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